Здравствуйте, Марина.

А каким способом он у Вас получил вид на жительство, он не говорил? Приходил устраиваться по РВП или по патенту? Или как беженец? Если по патенту и при этом до вида на жительство получал РВП в другом субъекте РФ, отличном от его места работы, то Вам надо год ждать с даты получения им РВП ждать, чтобы к вам не пришли с проверкой. Потому что при наличие РВП в другом субъекте, он у вас работал нелегально.

Если же он получил вид на жительство после получения статуса НРЯ (носитель русского языка) или до получения ВНЖ работал у вас по разрешению на временное проживание, то не переживайте. Увольнять после получения ВНЖ вы его не должны. Просто сделайте задним числом дополнительное соглашение к трудовому договору, где укажите реквизиты вида на жительство и все.

Все может быть для вас очень плохо только в одном случае - если он работал по разрешению на работу ВКС (высококвалифицированного специалиста), а потом вдруг тайно оформил ВНЖ. В этом случае вы попадете на большие деньги, так как работодатели ВКС-ников не выплачивают страховые взносы, а если ВКС получил ВНЖ, то должны выплачивать.